Nació en Cerro de Pasco. Estudió en el Colegio Nuestra Señora de Guadalupe y se formó como médico en la Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Encontró la muerte a temprana edad, al inocularse voluntariamente sangre contaminada con la enfermedad de la verruga, a fin de anotar sus observaciones sobre la sintomatología para demostrar su transmisibilidad.
Su sacrificio permitió avances en la investigación sobre la enfermedad, que en su honor fue denominada "enfermedad de Carrión" y es considerado un mártir de la medicina peruana por su valentía y dedicación a la ciencia.